В Тункинском рифте вулканизм начался в миоцене, продолжился в плиоцене и плейстоцене. Рифт заполнился мощной толщей базальтов, переслаивающихся с осадочными породами. Базальты подразделяются на три слоя: нижний — миоценовый — мощностью 500 м, средний—плиоценовый — 200 м, верхний — плейстоценовый—450 м. Северный борт рифта— Еловско-Ахаликское плато несет покровы миоцен-плиоценовых и плейстоценовых базальтов