Эта островная дуга сложена реликтами древних складчатых поясов, которые в совокупности с миоцен-плиоценовыми прогибами образовали неогеновую островную дугу. Общая мощность земной коры достигает здесь 40— 42 км. Строение Японской дуги характерно тем, что в ней присутствует мощный гранитный слой, имеющий сложное строение. Вдоль всей дуги базальтовый слой имеет мощность 17 — 28 км. Его кровля находится на глубинах от 20 до 35 км. Особенности глубинного строения Японской дуги оказывают существенное влияние на распределение новейших влк. и на характер вулканизма. Структурам с максимальными мощностями тех или иных подслоев гранитного слоя свойствен кислый вулканизм с образованием игнимбритовых полей и больших кальдер типа кальдеры Кракатау. Структурам с относительно мощным базальтовым слоем присущи проявления основного вулканизма с образованием базальтовых плато, вулканических щитов, зон ареального вулканизма. Имеются и общие особенности в рас - пределении типов магм под Японской дугой, обусловленные разной глубиной питания влк. из верхней мантии.
Породы толеитовой магмы, залегающей относительно неглубоко, извергаются влк. восточной части северной половины о-ва Хонсю (на хр. Оу), а также на п-ове Сиретоко (о-в Хоккайдо). Эти влк. образуют как бы внешний пояс. Западнее его, вдоль западного берега северной половины о-ва Хонсю, распространены влк., извергающие более глубоко залегающие высокоглиноземистые лавы. Южное продолжение этого пояса—на п-ове Идзу, северное —на хр. Токати (центр о-ва Хоккайдо). Еще западнее, в южной половине о-ва Хонсю, в северной половине о-ва Кюсю, на берегах Японского моря распространены влк., дающие щелочные оливиновые базальты. Щелочная магма залегает в мантии наиболее глубоко. Новейшая вулканическая деятельность в Японской островной дуге началась в палеогене — более 30 млн. лет назад. Максимального развития она достигла в миоцене. В плиоцене произошло некоторое ее затухание. Она снова возобновилась с большой силой в плейстоцене, когда сформировались мощные покровы игнимбритов, потоки пирокластов, возникли большие кальдеры и стратовулканы. Современное распределение вулканов в дуге определяется плейстоценовой вулканической деятельностью. Стратовулканы и вулканические щиты, покровы игнимбритов и лав плейстоценового и голоценово - го возраста сохранились в рельефе хорошо. Миоценовые же влк. либо полностью разрушены, либо погребены под более молодыми образованиями и не выражены в современном рельефе.
Объемы вулканических пород в раннем и среднем миоцене составляли 150 тыс. куб. км, в позднем миоцене и плиоцене —они 20 тыс. куб. км, в плейстоцене — 5 тыс. куб. км. Тем не менее в плейстоцене и голоцене в пределах дуги возникло более 200 крупных влк. Часть из них (по одним источникам 42, по другим 60) сохранили активность до настоящего времени. Плейстоценовые и голоценовые влк. размещаются вдоль внутренних разломов дуги. Эти разломы были заложены в раннем миоцене, когда развивались новейшие геосинклинальные прогибы. Однако расположение плейстоценовых и голоценовых влк. только частично совпадает с этими прогибами. Более важную роль в распределении молодых влк. сыграли новейшие глыбовые структуры земной коры.
Исходя из общих химических особенностей лав (толеитовые, высокоглиноземистые, щелочные базальтовые) принято группировать современные влк. Японии в несколько вулканических поясов. Обычно выделяют следующие пояса: Насу (запад о-ва Хоккайдо, центральная зона на севере о-ва Хонсю), Токаи (западный берег северного Хонсю), Фудзи (поперечная зона на Хонсю близ 138 меридиана), Норикура (центральная часть Хонсю), Дайсен (побережье Японского моря на западном Хонсю) , Унзен (северная часть о-ва Кюсю), Рююо (центральная часть о-ва Кюсю). Однако эти пояса прослеживаются не по всему их протяжению и проводятся по-разному. Поэтому при описании влк. Японской островной дуги мы будем придерживаться геолого-структурного принципа, распределяя влк. по островным глыбам и их составным частям.
