Эта система островных дуг расположена между активизированной молодой платформой Индокитайского п-ова и шельфами древней Австралийской платформы. Она протягивается на 10 тыс. км и охватывает дуги: Филиппинскую, Сула, Сангихе- Сулавеси, Банда, Алор-Бали, Яванскую, Суматринскую и Андаманскую. Они огибают погруженные подвижные плиты на территориях морей: Южно-Китайского, Сулу, Сулавеси, Банда, а также шельф Яванского моря и глыбу п-ова Малакка. С внешней стороны эти островные дуги сопровождаются глубоководными желобами: Филиппинским на востоке и Яванским на западе. На юго-востоке желоба отсутствуют, что связано с причленением Австралазийской системы островных дуг. Каждая из дуг имеет особенности в геологическом строении, в развитии вулканизма. Островные дуги в восточной половине Филиппинско-Индонейзийско - Андаманской системы имеют более молодые структуры, форму узких, сильно изогнутых поясов, огибают глубоководные котловины. В западной половине этой системы дуги представляют собой более зрелые тектонические структуры, переходные к орогенным. Они располагаются среди обширных шельфов.
Каждая из островных дуг системы отличается особенностями строения земной коры, развития вулканизма, формирования рельефа. Мощность земной коры Филиппинской дуги 20— 25 км, здесь развит гранитный слой. Она испытала недавнюю переработку, образование рифтов и орогенов. Это обусловило наличие больших о-вов, сводовую структуру дуги. Около нее расположены глубокие котловины внутренних морей с западной стороны, глубоководный желоб— с восточной. План дуги очень сложный. Дуга Сангихе-Сулавеси—это как бы сборная структура из разных частей бывших дуг и молодых платформ, что обусловило разное строение земной коры в пределах глыб островной дуги, разный рельеф.
Дуга Банда сформировалась вокруг блока земной коры, глубоко опущенного в мантию под морем Банда. Это молодая дуга, сформировавшаяся в плейстоцене (не более миллиона лет назад) из разновозрастных глыб земной коры. Ее о-ва— вершины подводных базальтовых влк. особого типа. Дуга Алор-Бали образует переход от опущенной дуги Банда к приподнятой Яванской. Она составлена несколькими ступенями, образованными большими глыбами земной коры с гранитным слоем. В ней имеются большие о-ва. Вулканизм характерен нарастанием кислотности магм по мере приближения к Яве. Яванская дуга—зрелая приконтинентальная дуга с гранитным слоем в земной коре, переработанной орогенезом. Глыбы земной коры слились здесь в большой о-в. Вулканизм характерен преимущественным развитием либо базальтовых, либо кислых магм.
Суматринская дуга—орогенная структура с мощным развитием рифтов. Кислый вулканизм получил здесь сильное развитие. Рельеф представляет собой большую горную систему с высокими глыбово-вулканическими горами и межгорными впадинами. Таким образом, имеется как бы симметрия в описываемой системе островных дуг. Расположенные на ее флангах Филиппинская и Суматринская дуги до известной степени сходны между собой, хотя и не повторяют друг друга. Это объясняют общим перемещением всей системы дуг в юго-восточном направлении и разломами со сдвигами на Филиппинах и Суматре.